当大蛇丸找到兜的时候，他正处在崩溃中，大蛇丸与团藏关系密切，自然知道内情，于是把团藏对兜的欺骗全部告诉了他，兜顿时觉得这个世界上已无自己的立足之地。这时大蛇丸对他说："我比任何人都重视你的才能，"我们一起创造一个与'根';截然不同，能够找到自我的组织，一个不属于任何国家的音忍村。从现在起，你我二人脱离了木叶，我就是你的上司、兄弟和父亲。"这一番话让兜死心塌地，而大蛇丸也确实没有辜负他，对他视如己出，给予了最大的信任。

这时大蛇丸注意到了一个正在崛起的神秘组织"晓"，于是派兜去调查底细。兜用双面间谍的身份打入晓，成为了蝎的部下，并故意透露了大蛇丸的情报，吸引蝎和佩恩上钩，其实大蛇丸打的是佩恩轮回眼的主意。但佩恩的实力超乎想象，大蛇丸眼看玩砸，于是顺势请求加入晓，为组织效力，恰逢晓组织缺人，就收了这个危险人物，于是大蛇丸又多了个身份—晓组织的"空"。

或许是因兜的助力，或许是因晓组织的资源，这段时间，大蛇丸的科研取得了重大成果，不但秽土转生之术接近完成，而且还开发了一种能够夺取他人身体的禁术—"不尸转生"，虽然这个术的CD长达数年之久，但凭借这个术，大蛇丸已然实现了永生，可以说往后只要他自己不作死，就能够用永恒的生命探寻他想知道的真理。

可惜理性与求知欲并存，当看到鼬的写轮眼，他又按奈不住自己的欲望，正好拥有夺取他人身体的禁术，正好鼬又来到自己的面前，他想要立刻领略写轮眼的风景。结果大蛇丸低估了鼬的实力，冒然发动的攻击被鼬轻易反制，如果不是兜赶来救援，大蛇丸的永生之路恐怕刚开始就要夭折了。

擅自对同伴出手，这晓组织显然是待不下去了，于是大蛇丸又叛离了晓，但很快就遭到了蝎和迪达拉的追杀。这一战可以看作大蛇丸的一次实战演练，这是他初次尝试秽土转生，复活了三代风影作战，虽然效果十分完美，被复活者不但拥有灵魂和生前的力量，而且还有不灭之躯，但控制力却不够，会被轻易挣脱，于是大蛇丸在蝎和迪达拉面前遁走，进行秽土转生之术的改良。

之后又过了数年的积累，大蛇丸实现了当年对兜说的话，他们建立了音忍村，培养了一批忍者，大多是各国流离失所的孤儿，因大蛇丸的意志聚集在了一起。大蛇丸给其中的精锐移植了地之咒印，也就是以君麻吕为首的"音忍五人众"，再加上北方据点的重吾，南方据点的香磷，音忍村的实力迅速壮大，甚至成为了被各国承认的村子，出现在了版图上，当然了，人们并不知道音忍村的首领大蛇丸。

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此时大蛇丸的秽土转生之术也已改良完成，同时找了一个年轻貌美的女性进行了不尸转生，大蛇丸的势力达到了巅峰期，这时，他开始打木叶村的主意了。也许是为了报父母之仇，也许是与团藏有暗中交易，也许是想引发战争，让自己的势力崛起，也许只是想向世人展示自己的研究成果，出于种种目的，大蛇丸动用了全部力量针对木叶。他和君麻吕一起干掉了四代风影，并用易容术伪装，以风影的身份控制了砂忍的力量，趁着木叶中忍考试的契机，以参赛的名义，让音忍和砂忍开进木叶村，而大蛇丸本人，乔装打扮后，也终于出现在了鸣人、佐助的面前。

大蛇丸此去木叶，除了守家的重吾和香磷，可以说是倾巢而出了，光是参加考试的就安插了三队人马，一队音忍的炮灰，一队伪装成木叶的兜小队，同时自己也易容后亲自参加考试。

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这就是他在剧中第一次登场的形象，多年之后重返木叶，他果然还是惦记着自己的学生红豆啊。至于他亲自参加考试、并遇到佐助显然不是偶然，大蛇丸的转生术使用间隔长达三年，此时已经到期，需要寻找下一个容器。大蛇丸对写轮眼垂涎已久，在晓时就曾对鼬出手，奈何打不过，于是目光自然锁定到了鼬的弟弟，年幼的宇智波家幸存者佐助的身上。大蛇丸此次木叶之行，很重要的一个原因就是为了得到佐助。

中忍考试第二场，大蛇丸很快就找到了佐助一行人，仅凭眼神迸发的杀气就让他们无法动弹。以他的实力，要杀此时的三位主角易如反掌，但他并没有这么做，甚至在发现鸣人是人柱力后，看到九尾的查克拉泄露，他还在上面加了道五行封印。虽然对鸣人来说扰乱了他的查克拉，但对木叶村来说，加固封印显然是一个有利的做法，如果大蛇丸真心想毁灭木叶，应该解放九尾，或是带走鸣人才对呀。

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中了封印术的鸣人失去了意识，小樱也不是战斗型忍者，场上只剩下了佐助。佐助还有家族大仇未报，不甘心束手待毙，危机之下写轮眼进化出了双勾玉。大蛇丸饶有兴致的测试了一番佐助的实力，这一段体术较量非常精彩，2003年的作画竟有如此水准，这种人物略微变形，动作粗放得有些抽象，同时注重技巧与忍术、忍具配合的火影式打斗风格，在这里第一次呈现。但佐助的体术还是太稚嫩，很快被大蛇丸打趴，最后佐助利用起爆符制造机会，拉出钢丝，用操手里剑之术加火遁·龙火之术将大蛇丸钉在树上，做了一道木炭烤蛇。

但这套华丽的操作并没有实质作用，大蛇丸面不改色的挣脱了钢丝，用束缚术轻易定住佐助，并在他后颈咬了一口，种下了咒印。这是理论生还率只有十分之一，实际生还率二分之二的天之咒印，寄宿了大蛇丸的灵魂力量，甚至可以从这个咒印中复活。面对全部倒地的三位主角，大蛇丸没有再出手，而是离开了。

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在大蛇丸休息时，另一位天之咒印拥有者，他在木叶时的徒弟红豆找上门来。大蛇丸跟她打了个招呼："好久不见啊，红豆。"但红豆却说："你已经是被通缉的S级叛忍，哪怕赌上性命，我也要在这里打败你。"大蛇丸淡淡的说："你办不到。"

红豆用潜影蛇手抓住大蛇丸，并结了双蛇相杀之印欲与他同归于尽，这时大蛇丸的声音从背后响起："红豆，你想自杀吗？那是替身。"红豆这才发现自己差点与一滩烂泥同归于尽。在咒印的压制下，红豆只能跪地，大蛇丸走到她身前，亲切的抚摸着她的脸颊，看来师徒久别，热情如斯。

一番交流后，大蛇丸离开了，红豆立刻会见三代火影商议对策，此时他们还不清楚大蛇丸筹划了战争，因此只是加强了戒备，并没有中断这场各国大名都来观看的盛会。宇智波佐助，火影木叶忍村宇智波一族的后代，年幼时候亲眼见证宇智波鼬屠杀族人的惨案，后来为了杀死鼬而努力修炼。但是由于宇智波鼬的错误诱导，佐助走上了与鼬期望相反的道路。最终在鸣人的帮助下，宇智波佐助重新回到他原来走精神道路上，成为木叶忍者村火影鸣人身后默默的支撑者。

在宇智波佐助的一生中，前半生是为了复仇而修炼，而后半生是为木叶忍者村而修炼。佐助的前半生生活通过动漫我们已经观看到，那么当动漫中没有描写到的时候，动漫暗线中佐助都在干些什么呢？其实虽然动漫没有直接描写，也给了很多隐含的线索。佐助出门在外，第一件事就是继续与木叶保持联系，经常将他所流浪的地方情报教给木叶。

因为忍界大战刚刚结束的时候佐助就已经出门在外调查各种事件，所以卡卡西当六代火影的时候才能不出门而知天下事，木叶的在忍界的权威才能有效维持下来。然后佐助出门在外，还解决了不少木叶前几代火影时期曾经留下的战争隐患。必须血龙眼事件，木叶派遣宇智波一族将血龙族的族人全部封印，导致卡卡西时代血龙族族人起爆人间，所以佐助出动之后，这件事情也就被解决了。

然后在《博人传》之前的剧场版中，佐助还在暗中保护着木叶，用自己的战力将威胁木叶的任何事情解决掉。剧情中，当月球陨石落向地球的时候，佐助出现并用身后的长剑将陨石斩碎，这个镜头其实表明了佐助并未离开木叶多远，通过轮回眼定位，佐助可以随时从很远的地方来到木叶附近。

然后就是调查大筒木事件了。火影中，大筒木辉夜姬身为外星人，而且是宇智波一族和木叶的旋涡、千手一族等多个种族的祖先。但是大筒木一族对地球忍者心怀恶意，所以宇智波佐助调查在外调查大筒木一族，帮卡卡西和鸣人做了不少无法解决的问题。虽然佐助看上去并没有起到多大作用，不过我们看完之后，还是觉得在博人时代中，他发挥的作用还是挺大的。

后在卡卡西封印佐助的咒印时，大蛇丸再次出现，可能是担心自己未来的身体有什么闪失。看到咒印只是被封邪法印抑制，大蛇丸放下心来，面对卡卡西"同归于尽"的威胁，大蛇丸只是说："如果你能做到，那就试试。"便头也不回的离开了。其实早在大蛇丸叛逃木叶的时候，还在暗部的卡卡西就曾奉命拦截他，他们之间有过一战，那时大蛇丸无论实力还是气势，都彻底碾压了卡卡西。这么多年过去了，面对大蛇丸，卡卡西还是颇为忌惮。

之后，中忍考试第三场终于开始了，这也是大蛇丸计划中发动进攻的时机。在这场考试中，大蛇丸伪装成风影，堂而皇之的坐在三代火影身边。大蛇丸对三代说："您的年纪也不小了。该早点决定下一任火影的人选了。"三代大笑着说到："我觉得自己还能再干五年呢！"他没有发现此时"风影"的眼神杀意已决。

比赛起初看起来一切正常，但暗中大批音忍和砂忍已在木叶村外围集结，兜也伪装成暗部，和其他音忍潜伏在会场，接下来到了我爱罗和佐助的比赛。

我爱罗正是大蛇丸行动的重要一环，原计划是在比赛中释放一尾砂之守鹤，并以此为信号，里应外合，一举征服木叶。可是没想到，比赛中我爱罗竟然被佐助的千鸟所伤，导致无法解放尾兽之力，不得已，大蛇丸只能跳过这一步，直接开始行动。随着兜施展大范围幻术，让会场里的普通人全部陷入沉睡，大蛇丸与三代火影四目相对，杀意夺眶而出。

一枚***在看台上**，烟雾中，大蛇丸挟持了三代，跳上房顶，同时潜藏在四周的音忍四人众立刻跟上，联手施展四紫炎阵，将木叶的援兵隔绝在阵外，大蛇丸与三代形成了1V1的局面。这时兜和会场内潜伏的其他音忍全部露面，牵制住了卡卡西等人，而村外的砂忍通灵出三头巨蛇，击破了木叶的城墙，攻入村内，木叶村顿时全面陷入战局。

此时三代终于识破了大蛇丸的身份，当年一时仁慈放走的爱徒，现在终于回来要取自己的性命，三代问他："为什么要进攻木叶？你不是个会因怨恨而行动的人。"大蛇丸说："我看到会动的东西就觉得有趣，看到不会动的就觉得无趣。我想用摧毁木叶这阵风来转动静止的风车。"两人间的决战正式开始。

一番试探后，三代脱下了斗篷，已是全副武装，看来三代预料到了今天可能会有战斗，而大蛇丸直接使出了刚完成的秽土转生之术。随着对方召唤出写有"初"和"二"的两具棺材，三代暗道一定要阻止第三具，第三具写着"四"的棺材果然没有召唤成功，不过这应该不是三代的作用，而是因为四代的灵魂已被封印，无法进行秽土转生。

虽然四代没有召出，但光是初代和二代就不是他能对付得了的，所幸大蛇丸的这次秽土转生精度不高，与他们生前的实力相去甚远。不过三代已经年迈，实力也是大不如前，以一敌三，无论忍术还是体术都全面落于下风。当三代被树界降临困住时，他用尽全力通灵出了猿魔王，虽然争取到了喘息之机，但仍然毫无胜算。

这时大蛇丸露出了她的真面目，撕下面具，竟然是一副年轻女性的面容。三代被震惊了，"难道你已经完成了那个禁忌之术？"大蛇丸放肆的大笑着："没错，这就是长生不老之术，让灵魂永存的方法！佐助将是我的下一个转生目标。"看到这里，三代下定决心，决不能让这个人活着离开木叶，否则太可怕了。于是当机立断，使用了那招，"尸鬼封尽"。这种直接封印灵魂的封印术，正是大蛇丸的克星。

三代先是用影分身分别锁定了秽土转生的初代和二代，将他们的灵魂封印在了自己体内，接着与猿魔王一起制造机会，抓住大蛇丸，就要扯出他的灵魂。感到自己的灵魂被掏出，大蛇丸大惊失色，情急之下控制草薙剑，刺向三代背部，三代没有丝毫避让，任凭利刃穿过。大蛇丸问他为什么不躲？三代回答："我根本没有必要躲，在封印结束时，我的灵魂也会被吞噬。这是必须要搭上性命的忍术！就让我们的灵魂一起，在死神肚子里永远斗争下去吧。"

这当然是大蛇丸最不愿意看到的局面，自己好不容易得到了永生，怎么能和这个风烛残年的老头一起死去呢！于是他拼命挣扎，超强的求生欲终于耗尽了对方的力量。眼看灵魂逐渐退回大蛇丸体内，三代只能退而求次，斩断灵魂，封印了大蛇丸的双手。小南VS带土在长门因为复活木叶的众人而死亡之后，为了拿回轮回眼，来继续自己的"月之眼"计划，带土选择去雨隐村寻找长门。而小南并不知道长门的轮回眼是来自宇智波斑的，为了守护长门的遗体，小南选择和前来夺取轮回眼的带土战斗。

因为小南非常清楚带土的能力，知道带土具有虚化瞳力而且也知道这个忍术的弱点。所以而为了这场战斗，小南准备了6000亿**爆符。把带土虚化和转移的时间都算进去了，如果不是因为伊邪那岐的存在，小南真的就成功了。可惜的是面对这种开挂般的忍术面前，小南真的是很不甘心啊。凯VS鬼鲛

鬼鲛的能力在"晓"组织中也是非常强大的，加上自身强大的查克拉以及大刀鲛肌的存在，因此鬼鲛也被称为"无尾尾兽"。另外他的忍术也能够吸收查克拉来不断壮大自身，这样的鬼鲛哪怕是在面对影级强者时都是不会虚的，但是他遇到的是完全不使用忍术的凯，最终也是倒在了凯的体术之下。不得不说鬼鲛非常的不甘心了。鹿丸VS飞段

而鹿丸作为鹿久的儿子，他自身的实力不是很强。与飞段直来直往的战斗方式不同，鹿丸的战斗讲究的是头脑。所以在这场鹿丸对战飞段的战斗中，飞段就被鹿丸用智商给压制了，最终被鹿丸炸碎封印在了地底。

鸣人VS牙这场战斗时发生在第一次中忍考试时，由鸣人的对战牙。当时的鸣人还是吊车尾般的存在，因为九尾查克拉的原因，此时的鸣人无论是修炼什么忍术都是很难的。综合实力来说是不如牙的。所以在这场战斗中，尽管鸣人对牙造成了一些困扰，但是按照这个局势发展下去的话，鸣人是打不过牙的。

但是不得不说主角的光环还是厉害，我们都知道牙主要的能力是依靠嗅觉和忍犬的配合在制敌的，而嗅觉的太过敏锐也不是一件好事。在牙即将取得比赛胜利的时候，鸣人放了一个屁，正是这个屁扰乱了牙的嗅觉，导致牙在后续的发挥中露出了破绽，最终被鸣人击败。相信牙的内心绝对是崩溃的...宇智波斑

说起来宇智波斑也是很悲剧的人物，就在自己即将实现自己的目标的时候，却被黑绝给偷袭了，在这种自己掌握一切的时候，突然被拉下神坛，尤其是在知道自己所做的一切不过都是假的地时候。相信斑的内心也是非常的不甘心了。一直以为自己是世界的救世主，没想到自己也不过是一个被别人玩弄于股掌之间的悲催人物。

在宇智波斑对着月亮狂笑的时候，黑绝突然在背后给他来了一个回手掏，于是斑急速变身，大筒木辉夜正式宣告复活。这个片段曾经遭到过无数粉丝的调侃，甚至有火迷说这是斑一生的耻辱。的确，在旁人的目光看来，六道斑是不可一世的大反派，即便真正的辉夜他也有实力比划两下，一个手无缚鸡之力的黑绝不可能仅用一击就真正击败他。但是仔细分析会发现，这个桥段或许没有我们想象的那么不堪。细说这个问题的话，那么就离不开黑绝的起源。

黑绝并没有实体，他是辉夜被封印前一刻临时产下的胎儿，它甚至没有自己的形体，更像是辉夜意志的化身。黑绝的特点也决定了他没有战斗力，因此他复活母亲只能借助外人的力量。封印辉夜的是她的两个孩子，大筒木羽村与大筒木羽衣，在辉夜被封封印之后，兄弟二人分道扬镳，大筒木羽村去月球做神灵，而羽衣则留在地球，成为了忍者们传说当中的六道仙人。

六道仙人后育有两子，分别是阿修罗与因陀罗，兄弟二人因继承忍宗的事情闹的不可开交，最终因陀罗在黑绝的蛊惑之下与父亲弟弟反目反目成仇。这真是黑绝想要看到的，只要极其双方的查克拉黑绝便可以复活母亲，遗憾的是因陀罗没有人气，最终败在了阿修罗之手。而且兄弟二人的轮回均是如此，没办法，黑绝只能继续等待下一个轮回。

这一等便是近千年，最终在宇智波斑这一代有了转机。斑不似前几任转生者那么实诚，他先咬下柱间的一块肉，并且通过诈死的方式躲过了二代火影的追捕，最终成功合成了轮回眼。后来通过吸收尾兽与神树等步骤，柱间才真正拥有接近六道仙人的体质。

而黑绝是辉夜产下的胎儿，严格来说是六道仙人的弟弟，拥有纯正的六道血脉，因此他的攻击完全可以对斑造成致命伤害。况且那时的黑绝附身于带土，借助带土的身体使得他具备了足够的进攻能力。六道斑的身体只不过对非致命伤免疫，直接攻击心脏与头部，对于他而言仍旧无法修复。因此无论从血统还是攻击方式的角度考虑，黑绝这一击是真实且可信的。